IT Business - Génjeink és a gépek

Topsztori

<article contentid="794915" referenceid="794915">
<title>Génjeink és a gépek</title>
<url>Fooldal/main_flash_banner/genjeink_es_a_gepek.html</url>
<starttime>
<timestamp ms="1268321580000">
<year>2010</year>
<month>3</month>
<day>11</day>
<dayofweek>5</dayofweek>
<hour>16</hour>
<minute>33</minute>
<sec>0</sec>
</timestamp>
</starttime>
<expired>false</expired>
<lead>
<formatted-text>

Kevéssé tévedünk el az orvosbiológia dzsungelében, ha szuperszámítógépet használunk, 
legalább olyat, amellyel másodpercenként 6500 milliárd műveletet lehet végrehajtani. 
És ez még nem is a legnagyobbak közül való.

</formatted-text>
</lead>
<body>
<formatted-text>
A fejlett világban már évek óta folynak szuperszámítógépekkel támogatott genetikai 
kutatások, amelyek célja az, hogy meghatározzák az emberiséget sújtó betegségek 
okait és azok gyógymódjait. A kutatókszámára a betegségeket kiváltó, génállományon 
belüli különbségek és változások felfedezése jelenti a legfontosabb feladatot. 
Ez a feladat azonban olyan méretű, hogy azzal csak a több száz, ezer, esetenként 
több tízezer processzort tartalmazó szuperszámítógépek képesek hatékonyan megbirkózni.

<embedded align="left" bottom="0" height="320" id="794910" left="0" right="0" title="A gardróbszekrény (Forrás: SGI)" top="0" width="252">
<image>
<title>altixice</title>
<description></description>
<url>/data/cms121747/altixice.jpg</url>
<width>252</width>
<height>320</height>
<place></place>
<source>SGI</source>
<metasize>-</metasize>
<thumbnail>
<image>
<title>altixice</title>
<description></description>
<url>/data/794909/tn_altixice.jpg</url>
<width>87</width>
<height>111</height>
<place></place>
<source>SGI</source>
<metasize>thumbnail: -</metasize>
</image>
</thumbnail>
</image>
</embedded>

Nos, a több száz processzoros kategóriába tartozik az -- a sajtónak a napokban 
bemutatott -- szuperszámítógépes rendszer, amely Magyarország legerősebb, tudományos 
célra használt gépeként elsősorban genomikai kutatásokat támogat. A Nemzeti Kutatási 
és Technológiai Hivatal támogatásával 2009. év elején indult, genetikai és rendszerbiológiai 
kutatásokkal foglalkozó, 4 éves futamidejű Genagrid konzorcium szuperszámítógépét, 
egy SGI Altix ICE masinát az MTA KFKI Részecske- és Magfizikai Kutatóintézet üzemelteti. 
A rendszer kapacitását elsősorban az asztma, allergia és leukémiai genomikai kutatására 
fordítják, de más magyarországi kutatási projektek adatelemzését segíti.
A konzorcium tagjai (BME Méréstechnika és Információs Rendszerek Tanszék, Csertex 
Kft., MTA KFKI Részecske- és Magfizikai Kutatóintézet, Semmelweis Egyetem- Genetikai, 
Sejt- és Immunbiológiai Intézet, Silicon Computers Kft.) mellett a projektet más 
is használhatja. A fő felhasználók a magyarországi és nemzetközi kutatók, illetve 
biotechnológiai, diagnosztikai és gyógyszeripari vállalatok. 
A szuperszámítógéppel a hazai orvosbiológiai kutatás itthon eddig elérhetetlennek 
látszó számítási teljesítményhez jutott, egyetlen kutatási cél elérése érdekében 
– mondta Temesi Tibor, a Silicon Graphics hazai kereskedelmi igazgatója. A megállapításnak 
van némi alapja, ugyanis az SGI által szállított Altix ICE fürt összesen 512 nagyteljesítményű, 
3 GHz órajelű Intel Xeon 5365 processzormaggal, valamint 1 terabájt memóriával 
rendelkezik, s másodpercenként 6,5 teraflopos teljesítményre képes. A szupergép 
a blade kivitelnek köszönhetően nem is nagy: a 64 darab kétfoglalatos pengeszervernek 
helyet adó ház nem haladja meg egy kisebb beépített gardróbszekrény méreteit.
Csak hogy tisztában legyünk a legnagyobb magyar tudományos kutatási célú szupermasina 
teljesítményével, összehasonlításul álljanak itt a világ legnagyobb szuperszámítógépének 
paraméterei: az  Oak Ridge-i National Laboratory (USA) található Jaguar (Cray 
XT5) 1,75 petaflops teljesítményű (1 petaflops másodperecenként 1 quadrillió lebegőpontos 
műveletet jelent), s mindezt több mint 224 ezer hatmagos AMD Opteron processzorral 
éri el.
</formatted-text>
</body>
<subtitle>Génjeink és a gépek</subtitle>
<priority>100</priority>
<source></source>
<author>Mártonffy Attila</author>
<keywords>
<kword>genomika</kword>
<kword>Nemzeti_Kutatási_és_Technológiai_Hivatal</kword>
<kword>Temesi_Tibor</kword>
<kword>Silicon_Graphics</kword>
<kword>Intel_Xeon</kword>
<kword>Red_Hat_Linux</kword>
<kword>Falus_András</kword>
<kword>Semmelweis_Egyetem</kword>
<kword>BME</kword>
<kword>Csertex</kword>
</keywords>
<seckeywords>
<skword>itbo_rss</skword>
<skword>hirlevelbe</skword>
</seckeywords>
<advisorimage>
<image>
<title>altixice</title>
<description></description>
<url>/data/cms121747/altixice.jpg</url>
<width>252</width>
<height>320</height>
<place></place>
<source>SGI</source>
<metasize>-</metasize>
<thumbnail>
<image>
<title>altixice</title>
<description></description>
<url>/data/794909/tn_altixice.jpg</url>
<width>87</width>
<height>111</height>
<place></place>
<source>SGI</source>
<metasize>thumbnail: -</metasize>
</image>
</thumbnail>
</image>
</advisorimage>
<referenceURL>Fooldal/hirek/legfrissebb/genjeink_es_a_gepek.html</referenceURL>
<modDate>1283521234078</modDate>
<contentWeekStartDay>2010_03_08</contentWeekStartDay>
<contentWeekEndDay>2010_03_15</contentWeekEndDay>
<folderurl>Fooldal/main_flash_banner</folderurl>
<folderfolderurl>Fooldal</folderfolderurl>
<pagenumber>1</pagenumber>
<response>
<result name="response" numFound="54" start="0">
<doc>
<str name="lead">Az ict-ipar minduntalan felrója a felsőoktatásnak, hogy nem piacképes végzősök jönnek ki az egyetemek, főiskolák kapuin. A BME-n most fordulni látszik a kocka: a szoros piaci együttműködés következtében a friss diplomás szinte azonnal termelőképes lesz.</str>
<str name="title">Nokia–Microsoft közös labor</str>
<str name="url">Fooldal/hetilap/hirhatter/Nokia-Microsoft_kozos_labor.html</str>
</doc>
<doc>
<str name="lead">Állami szinten támogatták a mobilról vezérelhető autós alkalmazások kifejlesztését, amelyben a BME szakemberei is részt vettek.</str>
<str name="title">Autófigyelő alkalmazás Androidra</str>
<str name="url">Fooldal/hirek/ict_n/igo_nng_eu.html</str>
</doc>
<doc>
<str name="lead">A BME hallgatói már szeptember óta tantárgyként vehetik fel a Windos Phone fejlesztését, de hamarosan professzionális körülmények között tehetik mindezt.</str>
<str name="title">Budapesti laboratóriumban kutat tovább a Nokia és a Microsoft</str>
<str name="url">Fooldal/hirek/ict_n/nokia_microsoft_bme.html</str>
</doc>
</result>
</response>
</article>

Génjeink és a gépek

Mártonffy Attila, 2010. 03. 11. csütörtök

Kevéssé tévedünk el az orvosbiológia dzsungelében, ha szuperszámítógépet használunk, legalább olyat, amellyel másodpercenként 6500 milliárd műveletet lehet végrehajtani. És ez még nem is a legnagyobbak közül való.

A fejlett világban már évek óta folynak szuperszámítógépekkel támogatott genetikai kutatások, amelyek célja az, hogy meghatározzák az emberiséget sújtó betegségek okait és azok gyógymódjait. A kutatókszámára a betegségeket kiváltó, génállományon belüli különbségek és változások felfedezése jelenti a legfontosabb feladatot. Ez a feladat azonban olyan méretű, hogy azzal csak a több száz, ezer, esetenként több tízezer processzort tartalmazó szuperszámítógépek képesek hatékonyan megbirkózni.

A gardróbszekrény (Forrás: SGI)

Nos, a több száz processzoros kategóriába tartozik az -- a sajtónak a napokban bemutatott -- szuperszámítógépes rendszer, amely Magyarország legerősebb, tudományos célra használt gépeként elsősorban genomikai kutatásokat támogat. A Nemzeti Kutatási és Technológiai Hivatal támogatásával 2009. év elején indult, genetikai és rendszerbiológiai kutatásokkal foglalkozó, 4 éves futamidejű Genagrid konzorcium szuperszámítógépét, egy SGI Altix ICE masinát az MTA KFKI Részecske- és Magfizikai Kutatóintézet üzemelteti. A rendszer kapacitását elsősorban az asztma, allergia és leukémiai genomikai kutatására fordítják, de más magyarországi kutatási projektek adatelemzését segíti.

A konzorcium tagjai (BME Méréstechnika és Információs Rendszerek Tanszék, Csertex Kft., MTA KFKI Részecske- és Magfizikai Kutatóintézet, Semmelweis Egyetem- Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet, Silicon Computers Kft.) mellett a projektet más is használhatja. A fő felhasználók a magyarországi és nemzetközi kutatók, illetve biotechnológiai, diagnosztikai és gyógyszeripari vállalatok.

A szuperszámítógéppel a hazai orvosbiológiai kutatás itthon eddig elérhetetlennek látszó számítási teljesítményhez jutott, egyetlen kutatási cél elérése érdekében – mondta Temesi Tibor, a Silicon Graphics hazai kereskedelmi igazgatója. A megállapításnak van némi alapja, ugyanis az SGI által szállított Altix ICE fürt összesen 512 nagyteljesítményű, 3 GHz órajelű Intel Xeon 5365 processzormaggal, valamint 1 terabájt memóriával rendelkezik, s másodpercenként 6,5 teraflopos teljesítményre képes. A szupergép a blade kivitelnek köszönhetően nem is nagy: a 64 darab kétfoglalatos pengeszervernek helyet adó ház nem haladja meg egy kisebb beépített gardróbszekrény méreteit.

Csak hogy tisztában legyünk a legnagyobb magyar tudományos kutatási célú szupermasina teljesítményével, összehasonlításul álljanak itt a világ legnagyobb szuperszámítógépének paraméterei: az Oak Ridge-i National Laboratory (USA) található Jaguar (Cray XT5) 1,75 petaflops teljesítményű (1 petaflops másodperecenként 1 quadrillió lebegőpontos műveletet jelent), s mindezt több mint 224 ezer hatmagos AMD Opteron processzorral éri el.

xEzt is figyelmébe ajánljuk:

Nokia–Microsoft közös labor

Az ict-ipar minduntalan felrója a felsőoktatásnak, hogy nem piacképes végzősök jönnek ki az egyetemek, főiskolák kapuin. A BME-n most fordulni látszik a kocka: a szoros piaci együttműködés következtében a friss diplomás szinte azonnal termelőképes lesz.

A rovat ajánlója

Üresen kong Citzalia

Hamarosan indul az EU közösségi projektje, amelynek segítségével a polgárok betekintést nyerhetnek az Európa Parlament életébe.

Megjelent az első 3D-s okostelefon-alkalmazás

Digitalizálódik a Magyar Televízó

Magyar alkalmazás tarol az Android Marketen

Naponta hatmillió iPhone-alkalmazás

Legolvasottabb cikkek

Magyarország is csatlakozott az ACTA-hoz

Országonként cenzúrázható a Twitter

Nem adják ki az USA-nak a Megaupload hírhedt kiberkalózát

Megaupload-bezárás után hacker-revans

Strapabíró lett a Classmate PC

Eseménynaptár

Kiemelt esemény:

Február 07.
Februári itbusiness Club

Március 07.
Business & Technology 2012

Aktuális lapszámunkból

A fejlesztés áraÚj ötletek megvalósítása helyett nagyrészt inkább a napi működés finanszírozására fordítódnak a kutatás-fejlesztésre és innovációra kiírt és elnyert pályázatok, de érdemi változás nem várható, mert a jelenlegi szisztéma fenntartása – eltérő okokból – minden szereplőnek érdeke.

Nokia–Microsoft közös laborAz ict-ipar minduntalan felrója a felsőoktatásnak, hogy nem piacképes végzősök jönnek ki az egyetemek, főiskolák kapuin. A BME-n most fordulni látszik a kocka: a szoros piaci együttműködés következtében a friss diplomás szinte azonnal termelőképes lesz.

Okos logisztikaLétfontosságú a beszállítói lánc kezelése egy globális óriásvállalat számára. Nagy utat kell azonban megtenni, mire egy cég elérkezik a 21. század integrált és intelligens hálózataihoz. Az IBM globális beszerzési igazgatójával beszélgettünk a logisztikai hálózatok evolúciójáról.